La electroforesis en gel de agarosa es de las más utilizadas para analizar y caracterizar ácidos nucleicos de distintas procedencias. Los geles se comportan como un tamiz molecular y permiten separar moléculas cargadas en función de su tamaño y forma. Así, moléculas de DNA de diferente tamaño van a emigrar de forma distinta en una electroforesis en gel de agarosa. Además, si en dicha electroforesis se aplican marcadores de peso molecular (fragmentos de DNA de tamaño conocido) se puede calcular el tamaño aproximado del DNA en estudio. En esta práctica, se pretende que el alumno comprenda el fundamento teórico de esta técnica
y sus aplicaciones, llevando a cabo la separación electroforética en gel de agarosa de DNA plasmídico que el mismo alumno va a aislar y purificar a partir de un cultivo bacteriano. Se han desarrollado un gran número de métodos para la purificación de DNA plasmídico de bacterias y todos ellos implican invariablemente tres pasos: crecimiento de la estirpe bacteriana portadora, recogida y lisis de las bacterias y purificación del DNA plasmídico.